हादसे की वजह यह सामने आई है कि यह मालगाड़ी बिहार से पत्थर लेकर आई थी। रेलवे लाइन के किनारे पत्थरों को उतारा जा रहा था। गोंडा रेलवे स्टेशन के प्लेटफॉर्म नंबर दो पर पत्थर उतारते समय अचानक दो बोगियों का संतुलन बिगड़ गया। एक तरफ ज्यादा और दूसरी तरफ कम पत्थर होने के कारण दोनों बोगियां पटरी से नीचे उतर गईं।
हालांकि, इस घटना में किसी भी प्रकार की कोई जनहानि नहीं हुई है। गोंडा रेलवे स्टेशन अधीक्षक रायसिंह मीणा ने बताया कि मालगाड़ी की दो बोगियां पटरी से क्यों उतरीं, इस पूरे मामले की जांच की जा रही है। मीणा ने बताया कि प्रथम दृष्टया ऐसा प्रतीत होता है कि पत्थरों को लाइनों के किनारे उतारते समय असंतुलन के कारण बोगियां पटरी से उतरी हैं। उन्होंने यह भी बताया कि पटरी से उतरी बोगियों को छोड़कर आगे की बोगियों को लोको पायलट के माध्यम से आगे भेज दिया गया है। जांच के बाद ही घटना के वास्तविक कारणों का खुलासा हो पाएगा।